Запутался вкрай.

public static void sort(String[] array) {
    for (int i = array.length - 1; i > 0; i--) {
        if (isNumber(array[i])) {
            i--; //это зачем?
        }
        for (int j = 0; j < i; j++) {
            if (isNumber(array[j])) {
                j++; //это зачем?
            }
            if (isGreaterThan(array[j], array[i])) {
                String s = array[i];
                array[i] = array[j];
                array[j] = s;
            }
        }
    }

    for (int i = array.length - 1; i > 0; i--) {
        if (!isNumber(array[i])) { //если это НЕ число
            i--; //???
        }
        for (int j = 0; j < i; j++) {
            if (!isNumber(array[j])) { //и если это НЕ число
                j++; //???
            }
            if (Integer.parseInt(array[i]) > Integer.parseInt(array[j])) { //тогда будем пытаться это парсировать в int - ?????
                String s = array[i];
                array[i] = array[j];
                array[j] = s;
            }
        }
    }
}

for (int i = array.length -1; i > 0; i--)